MATLABが起動時に設定する変数MATLAB_ARCHが設定されていない場合に発生するエラーです。まず、MATLABを再起動してください。
MATLABの再起動で問題が解決しない場合は、[PassBOX2インストールフォルダ]\matlab\rtw\c\grt\ フォルダにあるsbox2.tmfファイルをテキストエディタで開き、%MATLAB_ARCH% を 32bit または 64bit Windowsを示す win32 または win64 に置き換えて上書き保存してください。(他のテンプレートmakeファイルをご使用の場合も同様に変更してください)